Genç Ruuji Familon, bir kurtarma görevi sırasında Liger tipi bir Zoid bulur. Başlangıçta köy, Bio-Raptor Bio-Zoids ve daha sonra bir Bio-Megaraptor tarafından saldırıya uğrar. Köyün jeneratörü çatışmada yok edildikten sonra Ruuji, Murasame Liger Zoid'i alır ve bir jeneratör tamircisi bulmak için Ra-Kan ve Rei Mii ile birlikte köyü terk eder, aksi takdirde köy yok edilecektir. Ruuji, yolculuğu boyunca Digald'a karşı savaşması gerektiğini öğrenir.