Önümüzdeki 30 yıl içinde Tokyo'da 7.0 büyüklüğünde bir depremin meydana gelme ihtimalinin %70 veya daha yüksek olduğu tahmin ediliyor. 2012 yılında ortaokul birinci sınıf öğrencisi Mirai, yaz tatilinin başlangıcında kardeşi Yuuki ile birlikte Tokyo'nun yapay Odaiba Adası'na bir robot sergisi için gider. JMA ölçeğine göre 8,0'ı kaydeden güçlü bir sarsıntı, bir okyanus çukurundan yayılıyor, ünlü Tokyo Kulesi ve Gökkuşağı Köprüsü parçalanıp yıkılıyor ve Tokyo'nun manzarası saniyeler içinde değişiyor. Mirai ve Yuuki, Odaiba'da tanıştıkları Mari adlı motosiklet teslimatçısının yardımıyla Batı Tokyo'daki Setagaya'daki evlerine geri dönmeye çalışır.