Hikaye, insanların "bilinmeyene", yani insanlığın düşmanına karşı savaşlarını sürdürdüğü bir dünyada geçiyor. Onlarca yıl önce "bilinmeyenlerin" istilası sırasında soğuk bir uyku tesisine tahliye edilen çocuklar, uykularından uyanır ve vücutlarının bazı doğaüstü güçler geliştirdiğini öğrenir. Ülkeyi Tokyo körfez kapısından çıkan "bilinmeyenden" korumak için erkekler ve kızlar Tokyo, Kanagawa ve Chiba şehirlerini savunmak için savaşırlar.