Papuwa geri döndü !Papuwa ve Chappi, Güney Pasifik'te bir yerde bulunan ilk Papuwa Adası'ndan ayrılalı 4 yıl oldu... "Gamma" adlı çetenin büyük patronunun kardeşi Kotaro, "Mavi Mücevher"in çağrısıyla uzun uykusundan uyanır ve "Gama"nın karargahından gizlice denize doğru yola çıkar. Dönen büyük dalgalar tarafından yutulunca garip bir adaya sürüklenir ve Papuwa, Chappy ve Liquid tarafından bulunur. Bu adanın ikinci Papuwa Adası olduğu ortaya çıktı !! Kotaro hafızasını kaybetmişken, Liquid ona "Rotaro" adını verir ve onu bu durumda tutmaya çalışır çünkü Liquid, ilk Papuwa Adası'nı yok eden kişinin Kotaro olduğunu biliyor ve bir gün tüm anılarını geri kazanacağından korkuyor... Adada bir dizi komik olay ve maceradan geçen Kotaro, yavaş yavaş Papuwa, Liquid ve Ito-kun ve Tanno-kun gibi diğer tuhaf sakinlerle arkadaş olur. Ama dikkatli olun! "Gama" üyeleri Kotaro'yu yanlarında geri almak için adaya hücum ediyor...