Mobile Shinsengumi, Kyouto'yu, Japonya'nın batılılaşma çabalarını engelleyecek etkilerden, her şekil ve boyuttaki iblisler ve canavarlardan veya Kyou şehri için zamanı geri çevirmeye kararlı bir grup insan düşmanından korumak için özel bir amaçla organize edildi. Yuuko Kondou, Toshie Hijikata ve Kaoru Okita, ünlü Isamu Kondou, Toshizou Hijikata ve korkulan orijinal Shinsengumi'nin liderleri Soushi Okita'nın kızlarıdır. Bir zamanlar babalarının sahip olduğu gibi "Hakikat" bayrağı altında ve Oryou Hanım'ın rehberliğinde bir araya gelmişlerdir. Oryou'nun oğlu Ryuunosuke, Shintarou, Gennai ve kedi canavarı Nekomaru'nun yardımıyla Kyouto'yu gölgelerde gizlenen kötülükten korurlar. Peki Kyouto halkını Mobil Shinsegumi'den kim koruyor?