Honnouji Akademisi, öğrenci konseyi ve başkanı Satsuki Kiryuin'in demir yumruklu kontrolü tarafından zorla yönetiliyor. Transfer öğrencisi Ryuko Matoi, aslında makasın yarısı olan dev bir kılıçla kampüse gelir. Babasını öldüren kılıcının diğer yarısını tutan kadını arıyor. Satsuki Kiryuin'in katilin kimliğini bildiği söylenir ancak Ryuko onunla yüzleştiğinde öğrenci konseyi ve onların gücüyle karşılaştırılamayacağı güçlü "Goku Üniformaları" tarafından dövülür. Ancak Ryuko, Senketsu adında kendi "Kamui"sini aldığında şans onun lehine artar.