Deniz Korsanı Kaptan Harlock ve başıboş samuray Tochiro, Batı Sınırından Amerika Birleşik Devletleri'ne gelir. Yolda karşılaştıkları gizemli bir kadınla birlikte iki arkadaş, seks çetelerine, haydutlara ve yozlaşmış bir şerife meydan okur. Kayıp bir Japon göçmen klanını arıyorlar ve onu bulana kadar Gun Frontier'ı uçtan uca parçalayacaklar.