Tanrı tarafından seçildiği söylenen ve sonunda insanlığın yok oluşu olacak olan mutasyona uğramış bir homo sapien olan Diclonius'un kafasında iki boynuz vardır ve ona telekinetik yetenekler kazandıran "altıncı hissi" vardır. Bu tehlikeli güç nedeniyle hükümet tarafından yakalanıp laboratuvarlarda izole edilmişlerdir. Genç ve psikotik bir Diclonius olan Lucy, sınırlarından kurtulmayı başarır ve laboratuvardaki gardiyanların çoğunu vahşice öldürür, ancak kaçarken başından vurulur. Hayatta kalır ve Kouta ve Yuka adlı iki gencin onu keşfettiği bir sahile doğru sürüklenmeyi başarır. Hafızasını kaybettiği için ona artık söyleyebildiği tek şeyin adı verilmiştir: "Nyuu" ve ikisi onun Kouta'nın evinde kalmasına izin verir. Ancak görünen o ki şeytani "Lucy" henüz ölmemiş...