Uzak gelecek: İnsanlık, harap olmuş çorak arazi üzerine hareketli kale şehri Plantation'u kurdu. Şehrin içinde, "Kuş Kafesi" olarak da bilinen Mistilteinn adlı pilot mahalleleri vardı. Çocukların yaşadığı yer orası... Hayattaki tek görevleri kavga etmekti. Düşmanları Kyoryu olarak bilinen gizemli dev organizmalardır. Çocuklar, henüz görünmeyen bu düşmanlarla yüzleşmek için FRANXX olarak bilinen robotları çalıştırıyorlar. Bunların arasında bir zamanlar dahi çocuk olarak anılan bir çocuk da vardı: Kod numarası 016, Hiro. Bir gün Hiro'nun karşısına Zero Two adında gizemli bir kız çıkar. "Seni buldum sevgilim."