Usta Kılıç Ustası Eiji Shinjo, bir yıl boyunca hain şampiyon Gaia ile yaptığı savaşın anısını aklından çıkarmadı; bu savaş, "örgüt" olarak bilinen kötü niyetli örgütün güçleri tarafından yarıda kesildi. Zaferi reddedilen Eiji, rakiplerinin alaycı kahkahalarıyla turnuvadan ayrıldı. Daha da kötüsü, Eiji uzun süredir kayıp olan kardeşi Sho'yu bulmaya yaklaşamadı. Ancak şimdi gizemli bir savaşçı, önceki turnuvanın şampiyonlarını avlıyor ve onlara karşı kendi hareketlerini kullanıyor ve görünüşe göre bu kişi Sho olabilir. Bu güçlü yeni düşman kim ve bir sonraki hedefi kim? En yakın arkadaşı ve en büyük rakibi Eiji ve Kayin, onlar da mağlupların saflarına katılmadan önce gizemi çözmeye çabalar. Cevap, Örgütün ve onun dünya hakimiyeti planlarının kalbinde yatıyor. Sonunda dünyanın en büyük savaşçıları arasındaki nihai savaş belirlenecek. Ama Eiji kaybederse arkadaşları Ellis ölebilir...