Her 30 yılda bir Hime ailesinden Hayagami'ye hizmet etmek üzere yeni bir prenses seçilir. Zamanı yine geldi ama geçtiğimiz yıllarda kayıtlar, 15 yaşındaki Arata dışında tek bir dişinin bile doğmadığını gösteriyor. Tek sorun Arata'nın aslında bir erkek olması! Kendini gizlemek ve resmi bir aday bulunana kadar prenses adayının yerini almak zorunda kalan o, festivale yalnızca mevcut prenses Kokuri-hime'nin öldürülmesine tanık olmak için katılır ve kendi hayatının da prensesin kişisel koruması 12 Shinshou'nun elleri tarafından kaybedilmesine tanık olur. Canını kurtarmak için koşan 12 kişiden Kannagi, herkesi prensesi öldürenin Arata olduğuna ikna eder ve şimdi İmparatorluk Sarayı'ndaki herkes onun kafasının peşindedir!