Angel Beats öbür dünyada geçiyor ve öldükten sonra hayatına dair anılarını kaybeden Otonashi'ye odaklanıyor. Ölümden sonraki yaşam okuluna kaydolur ve Yuri adında bir kızla tanışır ve kız onu, Tanrı'ya karşı savaşan bir organizasyon olan Ölümden Sonra Savaş Cephesi'ne katılmaya davet eder. Battlefront, doğaüstü güçlere sahip bir kız olan öğrenci konseyi başkanı Angel'a karşı savaşır.